Intune permet le déploiement de plusieurs types d’applications :

Voici le détail de chaque choix :
| Type d’application | Format / Extension | Prérequis OS | Contexte d’installation | Scénarios typiques |
| Application Windows (Win32) | .intunewin | Windows | Device ou User | Permet de créer votre package afin de déployer les applications métier, outils internes, logiciels lourds, scripts PowerShell |
| Application Microsoft 365 | Click-to-Run (C2R) | Windows | Device | Permet de déployer Office 365 (Outlook, Word, Excel, Teams) |
| Application métier | .msi .appx, .msix APK IPA |
Windows | Device ou User | Windows (.msi, .appx, .appxbundle, .msix et .msixbundle) Android (APK) iOS (IPA) macOS (.pkg) |
| Application du store (nouvelle) | Store link | Windows | User | Apps du Store (OneNote, Calculatrice, etc.) |
| Lien Web Windows | URL | Tous OS avec navigateur | User | Permet de créer un lien vers une application web dans le menu démarrer |
| Microsoft Edge | Automatique via Intune | Windows | Device |
Il est forcément plus facile d’utiliser des packages fournis avec l’application (.msi, .msix) mais parfois l’application ne fournit qu’un fichier exécutable, ou un ensemble de fichiers à déployer, dans ce cas il faut créer votre propre package .intunewin.
Le choix des applications disponible dans le store est limité, mais il existe des solutions pour trouver de plus grand nombres de package gérés à votre place, comme avec Robopack.
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